巫凯，句容人。由庐州卫百户积功升至都指挥同知。永乐六年(1408)，巫凯因跟随英国公张辅平定交趾有功，升为辽东都指挥使。十一年，巫凯奉诏率所部会集北京。第二年，随军征讨沙漠，受命先返。巫凯建议诸卫兵应当以三分之二负责防守，三分之一屯田种粮，并将在开原买入的马匹全部交给本卫操练。这些都被采纳。
宣宗即位后，巫凯以都督佥事的身份佩带征虏前将军印，代替朱荣镇守辽东。当时对从塞外逃回的中原人，朝廷下令全部送往京城，等其亲属前来认领。巫凯却说远道往来，恐怕会使他们流离失所，从而阻碍远方人们的慕归之心。朝廷于是改为将有马的人及年少体壮者送往京城，其他的可以自便。敌寇抢掠西山，巫凯率军击败之，缴获敌寇所抢掠的全部东西，皇上降旨褒勉他。
皇上曾派遣使者在松花江造船招抚诸部。因为地处偏远，军民转运十分艰难，许多人逃亡。当时正有紧急情况，巫凯极力请求停止此役，而加入海西诸部的逃兵已有五百余人。不久，重又开始造船劳役，由宦官阮尧民、都指挥刘清等监督管理。他们多行不法，以致造成激变。巫凯弹劾阮尧民等人，将他们交给司法官吏审问治罪。
英宗即位后，巫凯升为都督同知，他上奏八件边防事宜。他请求厚恤那些为国效力而死者的家人，增加官吏的折俸纸币，每年供给士兵冬天的衣服、棉布，军中口粮、草粮一切照旧，并且应招来商人充实边境。朝廷都应允实行。不久，巫凯被兵部尚书王骥所弹劾。朝廷知道巫凯很贤能，命巫凯诉说自己的情况。并且谕示廷臣，文武百官中如果有罪，必得得到证据后才能上奏，诬告者罪不能免。巫凯因此得以去实现他的志向。正统三年(1438)十二月，巫凯得病，皇上命医生迅速赶去看病，人还未到，巫凯便去世了。
巫凯性情刚毅，富有智谋，对部属严而有恩。他在辽东三十余年，威惠并行，边防大获整顿。前后驻守东方边陲的人，除了曹义之外，谁也不能与巫凯相比。